非小细胞肺癌ALK融合基因的鉴定
肺癌的精准和个体化医疗对病理学诊断的带来了很多变化和挑战。简单地将肺癌分为小细胞和非小细胞肺癌（NSCLC）已经不能满足医治患者的需要。把NSCLC更加具体地分为不同亚型，对于选择治疗方案非常必要，这同样也是对病人进行分类，推动了相应的分子学检查。这种策略的核心是检测EGFR突变和ALK基因重排。对于病理学家而言，处理这些样本最主要的挑战是肿瘤组织的管理和保存，以便顺利完成具体的诊断和合适的分子检查。
肺癌个体化医疗的发展对病理学诊断影响巨大，目前的挑战主要集中于分子诊断对小组织标本需求的日益增长。本综述主要对如何成功鉴定ALK基因重排的NSCLC提供了一些建议。正确处理和保存肿瘤组织在诊断中是非常重要的，例如储存可直接用于分子诊断的组织切片可使检查更为迅速并节省组织。在绝大多数情况下，使用2个组织切片进行免疫组织化学（IHC）染色已经足够了，使用超过2个切片是一种浪费，并且降低了分子诊断的可能性。荧光原位杂交（FISH）是第一个被FDA批准的ALK检测方法，它的主要优点是通常不被病理实验室的组织前处理所影响；主要的缺点是分析FISH的结果需要专业知识和经验。逆转录-聚合酶链式反应也可以鉴定ALK融合基因的mRNA，但是受到mRNA质量的限制，而且一些少见的ALK融合变异可能不会被检测到。最近，下一代测序技术（NGS）为检测ALK基因重排提供了另一种方法。虽然目前的经验有限，但是随着需要检查的基因变异数目的增加，NGS将会成为最有效的检测方法。ALK基因重排的检测应该成为常规检查项目，因为ALK酪氨酸激酶抑制剂治疗已经成为一线治疗方案。治疗指南推荐对所有确定的和可能的肺腺癌，需同时进行EGFR和ALK基因检测。从组织利用和这两个基因变异的检查周期的角度来讲，这种方法是最有效的。考虑到ALK抑制剂所带来的临床获益，鉴定ALK基因重排对于NSCLC的诊断非常重要。随着对科学的深入理解和诊断技术的不断发展，ALK基因变异的检测将会不断进步并且带来新的挑战。
